Salta al contingut principal
DATOS-CAT: connectar les cohorts per multiplicar-ne l'impacte

DATOS-CAT: connectar les cohorts per multiplicar-ne l'impacte

IP: Rafael de Cid (IGTP)

Barcelona Supercomputing Center (BSC)

Abast: Nacional

Temes:
  • Genòmica i variació poblacional

Dades que parlen el mateix idioma

Catalunya disposa de cohorts poblacionals valuosíssimes, però perquè el seu potencial es desplegui del tot cal que les seves dades es puguin trobar, compartir i combinar. DATOS-CAT treballa precisament per augmentar la visibilitat i l'impacte científic de les cohorts poblacionals catalanes i millorar-ne la interoperabilitat segons els principis FAIR (localitzables, accessibles, interoperables i reutilitzables).

Què fa

El projecte desenvolupa eines de codi obert que faciliten la integració i l'anàlisi de dades biomèdiques: un catàleg de dades (la plataforma MICA), eines de transformació als estàndards internacionals OMOP i mecanismes d'anàlisi federada (Beacon i DataSHIELD) que permeten estudiar les dades sense necessitat de moure-les del seu origen, preservant-ne la seguretat. Les cohorts de referència del projecte són el GCAT i la subcohort de COVID-19 COVICAT-CONTENT.

Analitzar les dades sense moure-les del seu origen: així DATOS-CAT combina col·laboració científica i protecció de la informació.

El paper del GCAT

El GCAT és un dels conjunts de dades centrals del projecte: la seva cohort de ~20.000 persones seguida des del 2012 serveix de banc de proves per desenvolupar i validar aquestes eines. De fet, la plataforma MICA, que el GCAT ja fa servir per harmonitzar i gestionar les seves dades, és un dels resultats directes de DATOS-CAT.

 

Àrea: Infraestructures de dades · Interoperabilitat · Ciència oberta
Coordinació científica: Barcelona Supercomputing Center (BSC)
Consorci: BSC, IBEC, IGTP, CRG, CNAG, ISGlobal i Hospital Clínic de Barcelona
Finançament: Pla Complementari de Biotecnologia Aplicada a la Salut (Next Generation EU)
Paper del GCAT: cohort de referència del projecte, origen de la plataforma MICA

Promotors :
Logo Gobierno de EspañaLogo GENCATLogo IGTP
Amb la col·laboració de :
Logo Banc de Sang